'Blomsterdronningen' er den anden af fem film fra 'Det Gule Hus' - et stort hus på Nørrebro i København. Dette er en serie på fem magisk-realistiske historier om Chloë og Thea, to små piger, som går på opdagelse i deres store hus i jagten på eventyr bag naboernes døre og lige rundt om hjørne.
Chloe og Thea begiver sig ud på en odyssé gennem Det Gule Hus' små forhaver. Her finder de forskellige tilgange til livet - blandt andet viceværten Bjørn, der udrydder al ukrudt på sin vej - og hans modstykke 'Blomsterdronningen Paula', der føler at alle planter bør beskyttes. De møder også tvillingerne Ida og Johanne, der har skabt deres helt egen virkelighed.